En el año 1859, el Gobierno Federal de Loja, presidido por Manuel Carrión Pinzano, fundó la Universidad Nacional de Loja.
En los 166 años de vida institucional, el Alma Mater, ha tenido altos y bajos, clausuras, mengua de su patrimonio, hasta el recorte de su presupuesto que impide el ingreso de los bachilleres a la Universidad.
En la sesión conmemorativa, el rector Nikolay Aguirre Mendoza, anunció que, en el 2026, se dará la apertura de una extensión universitaria en Zaruma, provincia de El Oro y creación de extensiones con carreras en cantones de Loja, entre otros proyectos.
